獸藥土黴素的抗菌譜與四環素相似，主要是對革蘭陽性菌、陰性菌、沙眼衣原體、放線菌及螺旋體等都有效，對傷寒杆菌效果不明顯，所以土黴素主要是用于痢疾、沙眼、結膜炎和肺炎等。另外土黴素對衣原體、克次氏體、黴形體、螺旋體等也有抑制作用。

獸藥土黴素可以用于治療犢牛白痢疾、羔羊痢疾、仔豬黃白痢等，以及豬喘氣病、雞慢性呼吸道疾病，也可以用于治療狗的克次氏體病、貓的傳染性貧血。對于豬來說因為局部壞死引起的子宮内膜炎可以使用土黴素，也可以作為飼料添加劑，具有促進生長和提高飼料轉換率的作用。